Ранее препараты из листьев, краевых цветков применялись как горечь для возбуждения аппетита. Считается, что эти препараты обладают спазмолитическим и отхаркивающим действием. Подсолнечное масло обладает мягчительным, слабительным и желчегонным действием.

Применяется в медицине очищенное (рафинированное) масло при холециститах, холангитах, гипомоторнои дискинезии желчного пузыря, желчно-каменной болезни — по 1/4 стакана утром натощак (необходимо лечь потом на правый бок). Другие рекомендуют масло принимать по 1—2 ст. ложки натощак и в клизме (при желчных камнях). Кроме того, его рекомендуют для профилактики и лечения атеросклероза.
В народной медицине подсолнечник применяется также при малярии, ревматизме, спазмах бронхов, коклюше, коликах желудка и кишечника, колите, желтухе, геморрое, гриппе, ОРВИ, ожогах, экземе, ранах.

При экземе пользуются жидкостью, полученной при сухой перегонке плодов (семянок). При геморрое парятся над отваром шляпок подсолнечника.
Две—три ложки семян отваривают в 0,5 л подслащенной воды, пока останется 400 мл, процеживают — по 15—30 мл 3 раза в день при коклюше
Способы применения:1. Настой 1 ст. ложки краевых цветков в 250 мл кипятка — дневная доза (улучшающее аппетит, противоспастическое).
2. 20 % настойка цветков или листьев на 40 % спирте — по 5 мл 3 раза в день как № 1.
3. Отвар 20 г стеблей или корзинок в 0,25—0,5 л воды — по 15 мл 3 раза в день при спазмах бронхов, коликах в животе.
4. Подсолнечное масло — по 15—30 мл утром натощак за 30 мин до завтрака при атеросклерозе.
В огородах повсеместно разводят подсолнечник клубненосный (топинамбур, земляная груша), в клубнях которого много инулина.
Клубни используют при сахарном диабете в пищу сырыми, вареными или печеными и в салатах.